土榨油中可能保留了很多原料中的有益成分（酚類、VE、胡蘿卜素等），但同時，因為方法簡單，設備簡陋，出油環境較差，缺乏嚴格質量管理，土榨油也有令人擔憂的食品安全隱患：
小作坊生產，環境堪憂
小作坊式油廠生產條件簡陋，衛生難以保障，生產出來的油品大多數統一裝在大油桶里面，主要以散裝形式銷售。
原料篩選不過關，質量堪憂
因大多數小作坊人力物力資源有限，土榨原料基本沒有經過嚴格的篩選和檢測，有的小作坊為了獲得更高利潤，節約成本，甚至沒有考慮過要篩選原料，可能會使用混有霉變的原料榨油。比如，采用含霉變花生的原料得到的土榨花生油，其黃曲霉毒素（目前發現的最強化學致癌物之一，其毒性約是砒霜的68倍）很可能超標。此外，還有殺蟲劑、重金屬等污染的原料。
工藝粗糙，污染物堪憂
土榨預處理時會涉及高溫烘烤過程，其多環芳烴含量很可能超標。